Αν και οι περισσότερες οδοντικές παθήσεις μπορούν να αντιμετωπιστούν με ελαφρώς επεμβατικά ή και φαρμακευτικά μέσα, σε κάποιες περιπτώσεις οι χειρουργικές παρεμβάσεις είναι απαραίτητες για μία αποτελεσματική θεραπευτική αντιμετώπιση.

Χειρουργική εξαγωγή δοντιών και ριζών: Σε πολλές περιπτώσεις, χρειάζεται περιορισμένης έκτασης χειρουργείο για την αφαίρεση έκτοπων δοντιών και ριζών.

Χειρουργική εξαγωγή έγκλειστων δοντιών: Πρόκειται για την πιο συχνή ενδοστοματική επέμβαση, ειδικά όσον αφορά τους 3ους γομφίους ή φρονιμίτες. Δυσαρμονία στην ανάπτυξη του οστού των γνάθων σε σχέση με τον οδοντικό φραγμό, κάποιες φορές οδηγεί στην παραμονή των 3ων γομφίων σε λανθασμένη θέση σε σχέση με τα υπόλοιπα δόντια. Πολύ συχνά οι φρονιμίτες είναι έγκλειστοι και δεν ανατέλλουν ποτέ μέσα στη στοματική κοιλότητα. Άλλη μία κατηγορία δοντιών που συχνά είναι έγκλειστα είναι οι έγκλειστοι κυνόδοντες.

Χειρουργική αφαίρεση κυστών και μικρών καλοηθών όγκων: Οι κύστεις των γνάθων αποτελούν μια ακόμη συχνή παθολογική κατάσταση, οδοντογενούς αιτιολογίας, της στοματικής περιοχής. Επίσης στην στοματική μας κοιλότητα μπορεί να αναπτυχθούν καλοήθεις όγκοι, οι οποίοι μπορεί να εντοπίζονται είτε στους μαλακούς ιστούς είτε στα οστά των γνάθων. Η χειρουργική αφαίρεσή τους γίνεται μετά από λεπτομερή κλινικό και ακτινογραφικό έλεγχο, ώστε να αποκλείεται η περίπτωση κακοήθειας.